Windows® Embedded Server 2008 enterprise is identiek aan de traditionele Windows® Server 2008 enterprise. Het is niet toegelaten om Embedded Servers te gebruiken voor kantoorautomatisatie. Indien u een single-purpose applicatie heeft dan kan u Windows® Server 2008 enterprise for embedded systems gaan gebruiken aan een zeer voordelige prijs.De enterprise uitvoering biedt u in vergelijking met de standard edition o.a. meer hardware ondersteuning (tot 8 CPU's, meer virtuele machines, clustering ...)